主要的治疗方法是手术，也就是分开并在一起的两个手指，手指分开后，常常没有足够的皮肤来修复手指分开后的创面，因而需要作植皮术。同时手术的设计非常重要，设计不当，不仅会增加植皮的面积，同时影响外观，甚至手的功能。
并指畸形如何治疗
手术的大概设计可见示意图，这样的设计可以减少疤痕，降低植皮的面积，取得良好的功能。
先天性并指畸形是一种常见的手部畸形，可伴有手部或其他部位某些畸形，也可能是某个综合征的一部分。常在双侧同时发生，呈对称性。以发生在中环指间者最多见，有时可有3个、4个或全部手指并指。并指程度深浅不一，有的仅在指根部并指，表现为指蹼短浅;有的为全指并指，相邻手指完全连在一起。根据并联的组织不同，又可分为软组织并指和骨性并指，以前者多见。
并指手术时机要因人而左右异。如果畸形并没有引起手指明显的发育障碍，可在3-4岁行手术治疗。过早手术，患儿术后不易配合，也不好进行功能锻炼，植皮易发生挛缩，影响效果。如患病手指因并联而明显影响发育，可酌情提前手术。
如果仅为相邻两指并联，可一次手术完成分离;如三指或更多手指并联，需分次手术。手术原则是充分利用并联的皮肤组织，设计各种皮肤组织瓣以覆盖分离后的指侧创面，不足处移植皮肤覆盖。因此可在术前将并指向相反方向牵拉，长期坚持可能扩大并联皮肤的面积，可以改善手术效果。
脚趾的并指，因对功能的影响不大，如因美观原因确需手术，可年龄较大后在局麻下进行。