虽然研究表明，细菌性前列腺炎在前列腺炎中仅占很小的比例，为5%-10%，但一些学者坚持认为，绝大多数前列腺炎的发生都可能与细菌等病原体感染有关。即使是那些就诊时未能从其前列腺液中分离出病原体的前列腺痛患者，许多也曾经有过感染性前列腺炎以及抗菌药物治疗的病史。研究表明，前列腺炎患者的局部原核生物DNA的存在率可以高达77%。因此，细菌的抗原可能在启动了前列腺的炎症后转变为自我维持状态，可以不具有任何明显的感染征兆。但是细菌感染所出现的炎症过程可以改变前列腺胞内的微环境，造成抗原体复合物沉积、启动自身免疫反应机制，并影响到周围组织器官的正常功能等。
了解这些病原体的来源，并积极地采取预防措施，可以有效地控制或减少前列腺内病原体的感染数量和感染程度。那么，这些病原体究竟是从哪里来的呢?追溯病原体具体来源，可能包括以下几个方面：
(1)尿道。前列腺内常发生尿液反流，因此尿液中的病原体可以进入前列腺内直接诱发感染，这是前列腺感染的主要途径。引起前列腺炎的病原体主要来自于患者的尿道及其生殖系统的其他器官。
(2)肠道。直肠内的大肠埃希菌等细菌可以直接侵入或经过淋巴、小静脉或血流进行扩散。
(3)前列腺周围组织。前列腺周围组织内的病原体可以直接扩散或通过淋巴管蔓延侵入前列腺内。
(4)全身各处的感染灶。机体其他部位病灶内的病原体进入血流后经血液循环扩散也可感染前列腺。寄居在人体上呼吸道、口腔黏膜等处的正常菌群或感染人体其他组织器官的某些病原性微生物进入血流形成菌血症、败血症或脓毒血症时，微生物都可能随着血流扩散到前列腺而引起感染。
(5)尿道检查时的器械。在进行尿道器械检查时，细菌也可以随之带入到前列腺部尿道，引起前列腺的感染。
(6)性伴侣。细菌性前列腺炎还可能是由于性关系引起的尿道逆行感染的结果。一些研究已经证明了细菌性前列腺炎患者分泌的前列腺液内的病原体与他们的性伴侣阴道分泌物培养的结果相同。
(7)肛交。没有任何保护措施的肛门直肠性交可以引起大肠埃希菌性尿道炎、尿路感染和急性附睾炎，也是前列腺受细菌感染的重要来源。