再生障碍性贫血的主要临床表现为贫血、出血、发热和感染。由于病情进展的快慢、严重性以及病变广泛程度不同，临床表现也各不相同。我国将再障分为急性型和慢性型两类，两者的临床症状和体征也不相同。
1.急性型再障
急性型再障多见于儿童和青壮年，男性多于女性。起病大多急骤；常以贫血或出血发病，少数以发热发病。发病后病情迅速恶化，病程短。早期症状主要为血小板和粒细胞严重缺乏而引起的出血和感染，严重贫血的症状出现稍迟。出血严重，除皮肤、粘膜出血外，常有内脏出血，如呕吐、便血、尿血、子宫出血、眼底出血及颅内出血，其中颅内出血常常是导致本病死亡的原因。发热及感染严重，体温常在39℃以上，除呼吸道和口腔感染外，也可有肺炎、蜂窝组织炎、皮肤化脓性感染及败血症等。感染与出血可互相影响，感染是本病死亡的另一原因。
临床检查发现，急性型再障的临床体征表现为贫血面容，睑结膜及甲床苍白。一般无淋巴结及肝脾肿大。无黄疸。
2.慢性型再障
慢性型再障发病率成人多于儿童，男性多于女性。起病多缓慢，常以贫血发病，首先出现的症状常是面色苍白、疲乏、心悸、气急、头晕、头痛等。以发热、出血发病者少见。出血部位较少，程度也轻，常见的出血有皮肤粘膜出血和齿龈出血，女性可有程度不同的子宫出血，很少有内脏出血，感染少见，且较轻。
临床检查发现，慢性型再障的临床体征表现为贫血面容，睑结膜及甲床苍白，出血有无及轻重随病情而异。肝脾可有轻度肿大。然久病患者心尖区常有收缩期吹风样杂音。
急性与慢性两种临床类型并非绝对不变，两者是可以互相转化的。急性型再障如治疗得当，有可能病情逐渐减轻，转为慢性型；慢性型再障有时病情加重而转变成急性型。
再生障碍性贫血并发症除出现感染、内脏出血外，慢性型病例，由于长期贫血，晚期可发生贫血性心脏病。如输血过多，达10000毫升以上者，可发生血色病。