肛瘘的中医疗法是运用药物进行治疗，直接作用于患者的某一个病变部位，达到治愈肛瘘的方法，肛瘘外治法与内治法一样，都要进行辩证的治疗，根据疾病的不同而选择不同的疗法，下面就肛瘘的药物疗法进行介绍。
肛瘘患者的药物疗法
一、掺药
将各种不同的药物研成粉末，根据制方规律，并按其不同的作用，配伍成外用药，称为掺药。掺药的种类很多，应用于痔瘘疾病范围也较广，不论肛门周围脓肿、溃疡、瘘管、内外痔术后及肛门皮肤病，凡需要消散、提脓、拔毒、生肌、收口等都可使用。由于疮疡性质和发病阶段不同，在运用掺药时，也应根据具体情况选择。掺药可撒于膏药上、油膏上，或直接撒布于疮面上，或粘附于纸捻上，再插入疮口内，以达到消肿散毒、提脓化腐、腐蚀平督、燥湿祛风、生肌收口和定痛止血等目的。
二、油膏
是将药物同油类煎熬为膏，或将药物捣为细末，与油类搅匀成膏的制剂，又称为软膏。可用猪脂、羊脂、麻油、黄蜡、白蜡和凡士林等调制。其优点是：柔软、滑润。油膏在肛门疾病中经常使用，一般通用于内痔、外痔、肛裂、肛门周围痈疽等，特别对肛门疮口腐烂面较大和一般肛门皮肤病更为适宜。
三、箍围药
古时称为敷贴，它是借药粉具有箍集围聚，收束疮毒的作用，从而促使肿疡消散。或即使毒邪结聚，一时难以消散，也可以使肿疡缩小，达到早日成脓和破溃，避免毒邪蔓延，波及周围组织间隙。如破溃后，余肿未消者，也可用它来消肿，解除余毒。所以，箍围药在临床治疗痔瘘科疾病中，应用较普遍，在外治法中，占有重要的位置。
四、生肌收口药
具有促进新肉生长，促使伤口愈合的作用。掺布疮面，能使疮口迅速愈合，要在疮疡溃后或术后，当脓水将尽或腐肉已脱、新生出肉芽的时候使用。瘘管、内外痔、脓肿术后，若只依靠机体的再生能力来生肌收口，时间上较为缓慢，应用此药则可促进其愈合。
五、止血药
具有收涩凝血的作用，适用于溃疡或术后出血，凡属于小络损伤出血者，可掺布于出血之处，外以纱布固定，可以促进伤口血液凝固，达到制止出血的目的。