乙肝小三阳和大三阳区别是乙肝大三阳E抗原阳性。乙肝小三阳通常是由乙肝大三阳转变而来，是人体针对E抗原产生了一定程度的免疫力。一般认为乙肝小三阳的传染性较小。但对于一些E抗原和E抗体均为阴性的人，它所感染的乙肝病毒可能是已经产生突变的病毒株感染，它不能表达E抗原和E抗体，但是如果检查乙型肝炎病毒去氧核糖核酸(HBV-DMA)依然阳性，表示病毒血症存在，仍然具有传染性。
乙肝大三阳是指在乙肝检查中HbsAg阳性， HBeAg阳性，抗HBc阳性。在乙肝两对半中是1、3、5项。乙肝小三阳是指在乙肝检查中HbsAg阳性，抗HBe阳性，抗HBc阳性。在乙肝两对半中是1、4、5项。乙肝大三阳与小三阳的区别主要在“表抗“和c抗体均为阳性的基础上e抗原的性质。
大量临床资料表明，乙肝大三阳患者体内乙肝病毒复制十分活跃，且其血液、唾液、精液、乳汁、宫颈分泌液、甚至尿液都可能具有传染性。
乙肝小三阳患者以HBV-DNA阴性多见，表示体内病毒数量较少。有时会出现检测不出来情况，虽然有病毒已经被完全消灭的可能，但是不排除仍然有少量病毒的可能，因此仍然有可能传染。病毒复制受到抑制，传染性小。如果小三阳伴有HBV-DNA阳性应该怀疑病毒变异的可能，建议做肝功能、B超等检查，以确定病情，随机改变治疗方案，同时预防肝纤维化等肝损伤。
乙肝小三阳照样有传染性，只不过血液循环内的病毒含量相对较低一些而已。肝炎病毒感染者的情况好不好，与是否为乙肝小三阳或乙肝大三阳无关，而与感染者是否有肝功能受损有关。
乙肝大三阳患者以HBV-DNA阳性比较多见，表示体内病毒数量很多，病毒复制活跃，传染性强。但是如果肝功能正常，无明显症状，就不建议抗病毒治疗，因为此时抗病毒效果差。如果伴有肝功能异常或肝活检炎性损害达到一定程度，或有明显症状者就需要治疗，同时要看是否有肝纤维化、肝硬化的产生，年纪稍大者且病程较长者应注意预防。