尿路感染按感染部位可分为上尿路感染和下尿路感染。
依据两次感染之间的关系可以分为孤立或散发感染（Isolatedorsporadicinfection）和复发性感染（Recurrentinfection），复发性感染可以进一步分为再感染(Reinfection)和细菌持续存在（Bacterialpersistence）：再感染指外界细菌再次侵入泌尿系引起的新的感染；细菌持续存在指复发性感染由存在于泌尿系中的同一细菌（如泌尿系结石或前列腺疾病）再次发作产生，也称为复发（Relapse）。
由于泌尿系统和男性生殖系统在解剖上是相通的管道系统，发生感染时临床上常难以明确区分，按感染发生时的尿路状态分类的方法对临床治疗的指导价值更大。可分为以下几类：
尿路感染治疗后
单纯性尿路感染（单纯下尿路感染和单纯上尿路感染）；复杂性尿路感染（包括导管相关的感染等）；尿脓毒血症；男性生殖系统感染：前列腺炎、附睾炎、睾丸炎、精囊炎等（不在本指南中）。