主要根据以下几点：
1.部位及分布假性湿疣主要发生于女性小阴唇，特别是小阴唇内侧和阴道前庭，呈对称密集分布;尖锐湿疣发生于外阴、阴道、宫颈、肛周，常见两个部位同时发生，一般不对称。武汉协和医院皮肤性病科刘厚君
2.皮疹特点假性湿疣为直径1-2mm的淡红色或白色丘疹，表面光滑，呈绒毛状或鱼子状外观，有时可呈息肉状小丘疹，可长期存在，一般长期无明显变化;尖锐湿疣皮损初起为小而柔软的淡红色疣状丘疹，逐渐增大增多，可呈丘疹，角化性斑块，乳头样或菜花样、鸡冠样赘生物，根部往往有蒂，有的甚至融合成较大的团块。易发生糜烂，渗液，带恶臭。颜色从粉红到灰白色。在干燥部位的疣体常较小，呈扁平丘疹，在潮湿部位往往呈乳头样或菜花样。
3.醋酸白试验假性湿疣为阴性;尖锐湿疣一般为阳性。
4.HPVDNA检测假性湿疣为阴性;尖锐湿疣一般为阳性。
5.病理检查有各自的特点。
有经验的医生一般根据临床特征即可区别二者，不典型时可做检查。