甲亢主要有药物治疗、手术治疗和放射性同位素131碘治疗等方法。临床上根据适应证选择治疗方法，药物治疗是基本治疗措施，可以单用控制甲亢病情，同时也是手术或同位素治疗前的准备用药。
理想的抗甲状腺药物应具备条件：能减少阻止甲状腺激素分泌，改善控制甲亢症状;能使肿大的甲状腺变软、变小;能使突眼症状好转恢复，而又没有粒细胞减少和肝功能受损等不良反应。疗程适中，很少复发，价格合理。
甲亢在祖国医学中属瘿瘤范畴，多为忧虑所生。认为忧伤心、心阴虚损、心情内伤与精神因素有关，病机属气郁化火，主脏皆为肝肾。
根据患者多有易兴奋激动、烦躁失眠、纳亢善饥、心悸、舌红津少、脉弦细数等。中医辨证以阴虚阳亢者为多，阴虚主要为肾阴虚，阳亢主要是肝阳亢。以此为本，抓住主要矛盾，制定滋阴潜阳、软坚散结、活血化淤的治则，选择丹参、墨旱莲、山药、夏枯草、煅龙骨、煅牡蛎等治疗。
当前临床使用最多的抗甲状腺药物是硫脲类(丙基硫氧嘧啶)和咪唑类(他巴唑);它们是抑制(减少)甲状腺激素生成(合成)，使体内T3、T4减少，来控制甲亢症状，改善病情的。临床应用多年，疗效确切，但疗程较长(通常需服药2年或更长)，停药后复发率可高达50%。此外，少部分患者可出现皮肤过敏(皮疹)、肝脏损害，个别患者可有粒细胞减少，严重者发生粒细胞缺乏，威胁着患者的健康，因此病人需频频复诊，观察病情，调整用药。
在应用抗甲状腺药物同时，对心率快的可加用β-受体阻滞剂心得安或倍他乐克;失眠、焦虑者可用镇静剂安定等，使症状改善，但这些属治标，即对症治疗。