肝脏损伤主要是由于自身免疫系统在识别并清除病毒时对肝脏或其他免疫细胞的免疫损伤作用造成的，以及免疫反应形成的抗原抗体复合物沉淀于血管壁及其他组织而引起的病变。同时，人体免疫反应的强弱与肝炎的轻重也有密切关系，正常情况下感染乙肝病毒后，一般表现为急性黄疸型肝炎，病后有足够的免疫力清除病毒而获得痊愈。
而体质差者因不能有效清除乙肝病毒而可能呈现出慢性携带状态，使病情经久不愈。
小孩肝脏相对成人来说，血供丰富，肝细胞再生能力强，但免疫系统不成熟，对入侵的肝炎病毒不能及时清除，且容易产生免疫耐受。因此，婴幼儿感染乙型肝炎后容易成为慢性携带者，尤其是有肝炎家族史的小孩。
孕妇比一般妇女更易患病毒性肝炎，其主要原因是由于妊娠后胎儿生长发育所需大量营养全靠母体共应，造成孕妇的肝脏负担大大加重，抗病能力也随之明显下降。
老年人身体各内脏器官的功能都会发生退化，其中肝脏改变亦很明显。首先，是肝血流量减少，肝脏吸收营养、代谢物质和清除毒素的能力也相应减退;其次，是肝细胞出现不同程度的老化，肝脏损伤后，肝脏的恢复能力下降。同时全身免疫功能下降，因此，老年人也是肝炎的易感人群。
喜欢在路边卫生条件不好的小店就餐的人，以及因病需要输血或血制品的人，或性生活不检点的人常易患乙型肝炎。
另外长期嗜酒者，可导致肝损伤，极易引起酒精性脂肪肝、酒精性肝炎，甚至于酒精性肝硬化。因肝脏是酒精代谢的主要器官，长期酗酒可导致脂肪浸润、肝细胞炎症、变性，引起肝功能异常。
总之，乙型肝炎的发生与预后原因很多，增强体质与免疫力是防止乙型肝炎的关键因素所在。