肛管直肠瘘主要侵犯肛管很少涉及直肠，故常称为肛瘘，是与会阴区皮肤相通的肉芽肿性管道。内口多位于齿线附近，外口位于肛周、皮肤处，整个瘘管壁由增厚的纤维组织组成，内附一层肉芽组织，经久不愈。发病率仅次于痔，多见于男性青壮年，可能与男性的性激素靶器官之一的皮脂腺分泌旺盛有关。
肛瘘有很多种类型，由于分类方法的不同，而有不同的名称，常见的分类方法有以下几种：
(1)按病变程度分类：
单纯性肛瘘：只有一条瘘管，内外口直通的肛瘘。
复杂性肛瘘：瘘管和外口在两条或两个以上，但内口可以是一个或多个的肛瘘。
(2)按病变的深浅分类：
低位肛瘘：瘘管管道位于外括约肌深层以下的肛瘘。北京广安门医院中医肛肠科李华山
高位肛瘘：瘘管管道位于外括约肌深层或耻骨直肠肌以上，内口在齿线或齿线以上的肛瘘。
(3)按内、外口分类：
内盲瘘：只有内口而无外口的肛瘘。
外盲瘘：只有外口而无内口的肛瘘。
内外瘘：内口、外口和瘘道均存在，临床上最多见。
(4)按病理分类：
化脓性肛瘘：临床较常见。局部红肿热痛较明显，脓液粘黄稠，味恶臭。
结核性肛瘘：临床较少见。多有结核病史，局部红肿热痛水明显，脓液稀薄，色白。
(5)按病变的部位分类：
皮下瘘：瘘道位于肛门周围皮下，多由于肛裂感染引起。
粘膜下瘘：瘘道位于直肠粘膜下，多由于直肠粘膜损伤，或痔注射术后局部感染所致。
内外括约肌间瘘：可分为低位肌间肛瘘和高位肌间肛瘘。
坐骨直肠窝(肛提肌下)肛瘘：由坐骨直肠窝脓肿发展而来。
骨盆直肠窝(肛提肌上)肛瘘：由骨盆直肠窝脓肿发展而来。