胆囊结石、肝外胆管结石、肝内胆管结石表现各有特点。
胆囊结石初期多数没有症状。一部分在体检时，B超检查发现胆囊内有高回声光团存在，大约1/3则在胆绞痛发作时才得以诊断。如果胆结石在胆囊体部运动到胆囊颈部堵塞了胆汁向胆囊管的排出通道，由于胆囊内压力突然升高引起右上腹剧痛，可以痛得令人满地打滚。疼痛也可发生在心窝或左胸，向腰部、右肩背部放射。如果结石离开梗阻位置则疼痛可以嘎然而止。如果梗阻持续6小时以上可出现黄疸甚至并发急性胆囊炎。如果结石落进胆总管，会出现胆总管结石症状。B超或CT检查可以确诊。
肝外胆管结石平时即使体检也难以发觉。只有在它移行到胆总管下端开口处嵌顿引起胆汁排泄受阻时才出现症状。为缓起的右中上腹痛、腹胀、恶心，逐渐发展为剧烈疼痛，持续时间较长。梗阻久不解除会出现黄疸、继发胆道感染，严重的危及生命。借助胃镜下逆行胰胆管造影或磁共振胰胆管成像可以确诊。
肝内胆管结石多数症状轻微。有右上腹或肝区隐痛，多与感染有关。可有低热、黄疸。但是长期与感染共存可能严重损害肝脏。B超、CT、磁共振检查可诊断。